作惡多端的大鯊魚Troy又回來了！這次他揚言要趁漲潮之日橫掃整個珊瑚礁！曾經靠著自身力量而打敗大鯊魚的小魚小派，這次將再次肩負起拯救大家的使命。但問題是，這次Troy不再是單人匹馬，他身邊多了幾個跟隨的爪牙，而且他本身變得更加強大。于是在老海龜的建議下，小派決定把身邊幾個愿意跟隨的好友訓練成跟自己一樣能運用海洋力量的戰斗好手。但是操之過急的強化訓練并沒有取得理想的效果，反而讓大家深感疲憊和無力。Troy看準了這個機會，強迫被他在路上捉到的小鯊魚Ronny喬裝前往離間小派和珊瑚礁的居民，成功后就放他一條生路。為了活命Ronny不得不昧著良心前往搗亂。在老海龜的提點下，小派明白到凡事都不是靠自己一個人可以完成，群策群力才是解決問題的好方法！重新整理好思緒的小派回到了珊瑚礁，這時Ronny作為間諜的身份被揭穿了，更糟糕的是小派的女友被Troy抓走了！一方面要前往拯救女友，一方面要防御漲潮日鯊魚們的入侵，小派按照各人的長處為他們分配好工作。最終在大家的努力下，他們不但趕走了兇猛的鯊魚，還把小派的女友救回來，珊瑚礁又恢復了往日的平靜和歡樂。